More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5075 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  355  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  76.47 
 
 
172 aa  268  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  75.88 
 
 
172 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 
194 aa  184  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
194 aa  183  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
194 aa  183  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
159 aa  88.2  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.42 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.51 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.26 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.05 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.67 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.79 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  35.2 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  39.66 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  45.12 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  39.82 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  29.56 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  33.78 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  32.31 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  27.34 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
137 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
137 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.01 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 
168 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
128 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  30.46 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  33.02 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  31.85 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  28.67 
 
 
160 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
151 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  39.13 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 
174 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
213 aa  57.8  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  26.62 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>