More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  51.68 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  49.33 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  46.11 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 
155 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  48.89 
 
 
154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 
153 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  43.02 
 
 
175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  48.57 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 
161 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  51.2 
 
 
163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  43.45 
 
 
182 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  44.3 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 
159 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
155 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  36.67 
 
 
151 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 
157 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 
152 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 
166 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
149 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 
158 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.04 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
163 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.56 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40.25 
 
 
167 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
159 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 
160 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
161 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
164 aa  91.3  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
166 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  39.86 
 
 
160 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
166 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  36.36 
 
 
180 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
193 aa  87.8  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
157 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
165 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  37.5 
 
 
158 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 
159 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
170 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  35.95 
 
 
164 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
165 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
159 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  35.33 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.88 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  35.03 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  35.43 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  33.13 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  32.26 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
128 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>