More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4638 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  324  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  65.84 
 
 
168 aa  209  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
163 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
163 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  58.49 
 
 
163 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  60.42 
 
 
177 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  54.43 
 
 
160 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  43.71 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  41.61 
 
 
175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  44.08 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  42.74 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 
159 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  31.79 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  32.61 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.81 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.53 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  34.92 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40.18 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  34.81 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  31.52 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  34.48 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  30 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  29.14 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  26.57 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  27.1 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  27.16 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  40.24 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
185 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
157 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>