More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3930 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  349  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  56.77 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  48.41 
 
 		 160 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  39.87 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  36.07 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  34.39 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.24 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  36.61 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  32.86 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  33.94 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.86 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.81 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  29.05 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  28.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  26.62 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  29.03 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>