More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3981 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
200 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  44.97 
 
 
168 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  47.95 
 
 
170 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 
182 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 
174 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  44.81 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 
170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  42.95 
 
 
166 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 
169 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 
163 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 
160 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
163 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 
180 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
161 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  40.13 
 
 
175 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 
169 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
153 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
164 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  41.38 
 
 
180 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  43.57 
 
 
164 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
159 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 
155 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
159 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
157 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
166 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
163 aa  98.2  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  46.51 
 
 
160 aa  97.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 
155 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  43.7 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
166 aa  95.5  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  42.75 
 
 
160 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  39.07 
 
 
158 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
166 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40.15 
 
 
154 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
159 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
184 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  40.44 
 
 
161 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  40.69 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 
155 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  39.47 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  37.91 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.31 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  37.21 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  36.43 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  33.09 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 
157 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 
161 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
164 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  29.17 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  34.51 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
168 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 
160 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 
151 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
149 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
159 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
159 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
149 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 
166 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>