More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3063 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  67.53 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  42.66 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 169 aa  90.5  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  35.14 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.89 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  35.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  39.08 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  31.78 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  27.78 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>