210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3552 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 184 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 158 aa  95.9  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 193 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.58 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.23 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  33.82 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 186 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 169 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  30.22 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 180 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  32.14 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  29.79 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 180 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  35.66 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  28.28 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.63 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  26.06 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>