More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1502 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  330  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  72.19 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  50.98 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  51.39 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 182 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  49.01 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  47.74 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  47.89 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  46.84 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  47.56 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  48.91 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  43.23 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  46.58 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  43.06 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  43.92 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  46.38 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  51.2 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  45.7 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  45.03 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  44.83 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  43.57 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 200 aa  98.2  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 157 aa  97.1  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  42.15 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 180 aa  94.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.78 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  39.68 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 171 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 151 aa  87.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  37.01 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  35.76 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  36.57 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>