282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1172 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 168 aa  180  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  58.49 
 
 		 165 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  38.12 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  38.19 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.64 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  29.33 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 197 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  33.57 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.19 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 219 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  28.67 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  29.29 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  26.62 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  30.23 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>