More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5619 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  47.01 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  40.94 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.41 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.64 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.48 
 
 		 175 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  43.68 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.04 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  43.16 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.5 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  33.62 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  37.11 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 189 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>