More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2628 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 164 aa  316  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  52.78 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  48.3 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  49.32 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  36.76 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.08 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  33.57 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  34.86 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.04 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  45.57 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 182 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  44 
 
 		 318 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>