194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0809 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 189 aa  334  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  90.18 
 
 		 163 aa  297  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  87.01 
 
 		 165 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  88.44 
 
 		 162 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 169 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 147 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.98 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  88.2  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  87.8  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  30.72 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.48 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.16 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.16 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.5 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.34 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.08 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.52 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>