More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0766 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  57.52 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  40.62 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  40.8 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  42.48 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  41.28 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  38.68 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  35.25 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  31.4 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  28.35 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  29.03 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  31.36 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.44 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  37.18 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  33.62 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>