More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0891 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  313  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  60.94 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  45.24 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  47.41 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  48.62 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  42.74 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  39.8 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  40.65 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  39.53 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.23 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  30.84 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>