195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0249 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  82.1 
 
 		 162 aa  271  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  82.21 
 
 		 189 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  78.53 
 
 		 163 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 165 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  50.71 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.66 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.51 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0295  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  36.27 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  25.95 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 233 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  42.62 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.33 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.78 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.75 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  28.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.78 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  30.28 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  36.14 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>