More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1724 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
159 aa  309  9e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 
163 aa  124  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  48.44 
 
 
160 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 
184 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
167 aa  84.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.6 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  38.22 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  33.59 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  32.45 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.67 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.26 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  55.71 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  33.55 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  37.4 
 
 
179 aa  60.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.73 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  32.17 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.73 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.73 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.73 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  39.73 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  50 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  43.81 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  34 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  35.79 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  38.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  29.71 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.408457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>