More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0494 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  72.05 
 
 		 158 aa  238  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  73.86 
 
 		 161 aa  232  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 158 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  59.56 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  50.34 
 
 		 201 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  46.01 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 203 aa  147  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 194 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 194 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 204 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.97 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.25 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.06 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  32.46 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.17 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  27.85 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.09 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  28.04 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  26.99 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.68 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  24.5 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 312 aa  52  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  22.64 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  46.97 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 189 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 173 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  31.78 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  27.69 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>