More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2552 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  84 
 
 
155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  54.14 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 
163 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  40 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  34.07 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 
172 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  40.38 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  38.24 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 
183 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.81 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
169 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  36.36 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  33.62 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  50.7 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  28.29 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  33.88 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
194 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
173 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
184 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  38.32 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  38.37 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.08 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>