259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1565 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  27.92 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 183 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  32.26 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  34.21 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.78 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.78 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.05 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  41.1 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 168 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.31 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  38.55 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.51 
 
 		 319 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  36.49 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  32.56 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>