More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4026 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
168 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
167 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
162 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
162 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
186 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  48.59 
 
 
187 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  44.17 
 
 
163 aa  131  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 
158 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  54.7 
 
 
158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
186 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
167 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 
175 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 
194 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 
194 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  51.75 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
164 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
157 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
161 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
203 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
157 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
161 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
158 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
145 aa  99.4  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
164 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  45.45 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  44.12 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
146 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
120 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  35.34 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 
158 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  32.59 
 
 
146 aa  62.4  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.89 
 
 
162 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
138 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
149 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
166 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
151 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
148 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
151 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.76 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
137 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 
142 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
151 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  33.96 
 
 
150 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
157 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
169 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.73 
 
 
154 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 
140 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
166 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
147 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
147 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
156 aa  58.2  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  27.74 
 
 
158 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
147 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  41.58 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 
140 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>