More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0830 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 194 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 194 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  51.47 
 
 		 201 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  32.87 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  31.78 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.59 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.86 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.53 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.37 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  35.71 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>