More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3178 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  76.88 
 
 		 194 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  76.88 
 
 		 194 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  73.3 
 
 		 201 aa  261  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  54.6 
 
 		 175 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 162 aa  161  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  54.36 
 
 		 158 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  51.66 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 168 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 163 aa  148  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 157 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 145 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 157 aa  104  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  43.16 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  37.39 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.09 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  48.1 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.29 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  46.34 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35.34 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 147 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>