More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0731 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
187 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  34.45 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  33.58 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
204 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  25 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  32.39 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  30.15 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.91 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
334 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  36.59 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  32.43 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
135 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  32.38 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
340 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
340 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
326 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
190 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>