More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06415 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  100 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  32.09 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  35.65 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.81 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1049  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 200 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.23 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  35.79 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  25.21 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.7 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.41 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.41 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.41 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.41 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>