More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0365 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  306  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  60.67 
 
 		 152 aa  169  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  46.48 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  43.61 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  36.11 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  35.97 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  35.37 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.13 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  27.21 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  27.21 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  27.21 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  28 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.96 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  27.18 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  36 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  26.83 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  28.45 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  27.12 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  26.02 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>