More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0498 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
160 aa  308  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
150 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  34.69 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  34.69 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  33.79 
 
 
313 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  31.34 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
310 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.17 
 
 
283 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
307 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
309 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
320 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
334 aa  57.4  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.93 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
336 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.83 
 
 
325 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
347 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
352 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
326 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
347 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
329 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
321 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
313 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  41.56 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  38.75 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
340 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
326 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
340 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  36.08 
 
 
171 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.75 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
151 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  25.38 
 
 
158 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
326 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
326 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
322 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
326 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
164 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
325 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 
312 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  29.17 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
326 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4953  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>