214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0314 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  298  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 
144 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
156 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
145 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  46.21 
 
 
145 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 
148 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
155 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
155 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
138 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 
277 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  47.58 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  44.54 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  42.52 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  39.5 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  39.5 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  38.66 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  39.66 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  29.37 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  47.76 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  46.91 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  33.82 
 
 
139 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
156 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
153 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 
155 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  42.37 
 
 
287 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.25 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  38.55 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  42.03 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 
193 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.71 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>