176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4535 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 145 aa  286  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  92.91 
 
 		 144 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  45.38 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 169 aa  93.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  45.76 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.68 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  32.08 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  44.12 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  57.14 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  51.22 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  31.18 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>