More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1381 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
167 aa  333  9e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 
180 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  38.41 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  36.99 
 
 
163 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1154  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
162 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  36.63 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  34.02 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  35.05 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
149 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.7 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  30.22 
 
 
191 aa  61.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
136 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  30.69 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  30.69 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
204 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.54 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  30.3 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  33.88 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
135 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
144 aa  54.3  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
178 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
150 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
157 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
165 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
145 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>