205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5574 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  309  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  85.06 
 
 		 169 aa  263  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  66.41 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 137 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  67.19 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 137 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  64.06 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  64.8 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  56.34 
 
 		 139 aa  163  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  60.48 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  61.9 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  53.73 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  50.69 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  52.03 
 
 		 277 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  48.74 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 145 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  40.45 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>