191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5981 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 164 aa  301  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  45.69 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  45.19 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  42.98 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  45.87 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  40.34 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  44.04 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  47.31 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  43.93 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  51.43 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.44 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 213 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40.19 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  41.94 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  43.01 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  46.05 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  46.67 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  34.02 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  35.9 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  35.11 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  37.63 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  36.84 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2257  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>