More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2932 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
183 aa  363  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 
165 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
157 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  42.14 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.67 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  42.48 
 
 
140 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  40.62 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36.55 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  30.08 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  34.85 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  32.86 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.53 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  41.35 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  33.09 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  32.35 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  34.09 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.47 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.05 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
168 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.45 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  34.29 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
151 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
166 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.85 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  30.95 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  28.35 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>