More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3827 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  79.86 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  66.67 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  49.02 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  41.09 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  40.58 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.69 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 163 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  32.91 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.58 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  35.21 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  37.9 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.64 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  45.54 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  42.86 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  45.16 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  42.34 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  35.81 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  30.82 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  35.07 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  44.05 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  42.35 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>