276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2515 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  57.42 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 
160 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
197 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 
163 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 
180 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  45.81 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  50.71 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  48.57 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 
169 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
164 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 
170 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  42.96 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  44.85 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 
182 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 
149 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
160 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 
160 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
168 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  39.07 
 
 
168 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 
163 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  39.61 
 
 
159 aa  99  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  40.27 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  37.11 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  36.91 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.19 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.33 
 
 
197 aa  84.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  36.67 
 
 
158 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
151 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  39.04 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  31.95 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  31.82 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  34.59 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  32.53 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.22 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
159 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  37.96 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
168 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  30.06 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
233 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  37.38 
 
 
142 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
163 aa  57.8  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  30.07 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  30.3 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>