218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2001 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  55.03 
 
 		 170 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  58 
 
 		 163 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  58.57 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  55.86 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  54.05 
 
 		 170 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 		 166 aa  151  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  53.06 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 		 149 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  51.05 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  52.67 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 161 aa  141  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 159 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2515  transcriptional regulator, MarR family  50.34 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  47.59 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  51.7 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  46.79 
 
 		 169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  48.63 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  49.32 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  48.68 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  49.7 
 
 		 213 aa  121  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 		 159 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  44.74 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  44.65 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  42.38 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  46.9 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 172 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 166 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0927  transcriptional regulator, MarR family  44.06 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 164 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  42.95 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 157 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  39.49 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  40.27 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  42.76 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  38.93 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 155 aa  98.6  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 159 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 163 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.9 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.75 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 166 aa  87.8  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.6 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  36.18 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  32.67 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.11 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.01 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1081  MarR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1054  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.796516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1070  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  32.45 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>