More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0030 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  63.33 
 
 
169 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  63.76 
 
 
161 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  56.46 
 
 
156 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
152 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  49 
 
 
163 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 
160 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 
165 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
159 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  38.35 
 
 
175 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
137 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
163 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 
157 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
167 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  34 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
137 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  36.75 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  44.57 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
147 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  35 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
147 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  42.7 
 
 
132 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  39.6 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  37.25 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 
134 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  38.04 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  36.89 
 
 
158 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
167 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
180 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
151 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
163 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11940  transcriptional regulator  31.9 
 
 
180 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.11697  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
163 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
163 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
163 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0531  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.180365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
164 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
164 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  43.21 
 
 
164 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37380  transcriptional regulator  34.21 
 
 
170 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00623075  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 
159 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
142 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
169 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
166 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
155 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
166 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 
144 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 
153 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  40.7 
 
 
154 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
153 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 
164 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>