241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34890  transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.7983  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  45.06 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  34.42 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  27.13 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  37 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  37.27 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  34.41 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  34.11 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.44 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.08 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  37.14 
 
 		 261 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>