More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0789 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  84.32 
 
 		 185 aa  294  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  41.78 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  36.44 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  31.52 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  34.9 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  32.5 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  32.89 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  40.79 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  34.48 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  32.31 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  57.78 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  38 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 136 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  36.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  31.97 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>