More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0803 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  57.23 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  59.01 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  34.25 
 
 		 191 aa  98.6  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 161 aa  95.5  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 160 aa  94  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  35.66 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  33.83 
 
 		 161 aa  91.3  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  31.69 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  35.83 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 167 aa  87.8  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.72 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 158 aa  85.5  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  30.77 
 
 		 135 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  30.6 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.85 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  32.03 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.04 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  26.71 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.56 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  30.63 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>