More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2077 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  100 
 
 		 161 aa  320  7e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  83.23 
 
 		 160 aa  267  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  77.85 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  76.73 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  76.73 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  76.1 
 
 		 158 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 158 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 158 aa  243  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 158 aa  243  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 157 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  73.58 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  75.95 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 181 aa  178  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  54.09 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  53.55 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 174 aa  164  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  50.32 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  45.14 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  44.68 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  41.1 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  41.18 
 
 		 135 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 177 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.86 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  31.85 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.26 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  35.23 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>