More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2954 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  72.73 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  52.24 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  51.49 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 174 aa  90.5  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  34.78 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  30.08 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  33.83 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.32 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  30 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.94 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  31.65 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  32.8 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  45.12 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  28.45 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>