More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1337 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  316  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 160 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  77.42 
 
 		 160 aa  247  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  77.42 
 
 		 158 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 165 aa  244  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 165 aa  244  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 157 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  77.42 
 
 		 161 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  76.13 
 
 		 157 aa  241  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  75.48 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  70.51 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 181 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  55.84 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  53.21 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  55.19 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  46.85 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  40.69 
 
 		 191 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  47.14 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  42.96 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.55 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.88 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.26 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  31.85 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  32.99 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  27.03 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  34 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  33.65 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>