More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1245 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  96.2 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  96.2 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  96.2 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  95.57 
 
 		 158 aa  304  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  93.04 
 
 		 165 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  93.04 
 
 		 165 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  92.41 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 160 aa  273  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  83.54 
 
 		 161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 157 aa  266  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  81.53 
 
 		 160 aa  258  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  77.85 
 
 		 158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  76.73 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  55.19 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  55.06 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 174 aa  178  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  55.19 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 173 aa  150  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  44.83 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  45 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  41.35 
 
 		 135 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  36.81 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  37.41 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 177 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.46 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29.79 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>