More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1940 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
159 aa  322  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.4 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.37 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  27.81 
 
 
287 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  34.45 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
173 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.66 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  37.84 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  37.84 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.83 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  40.58 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  29.36 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
140 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
138 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
267 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
151 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  34.55 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>