More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4464 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
174 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.82 
 
 
178 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.65 
 
 
174 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.21 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.47 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
153 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  42.71 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  28.12 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  26.09 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  25.36 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
201 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  26.09 
 
 
176 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  26.09 
 
 
176 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  26.09 
 
 
176 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  26.09 
 
 
176 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  25.36 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.08 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  31.62 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
175 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>