More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4102 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 138 aa  276  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  99.28 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  71.85 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  38.52 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.58 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.79 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  37.61 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.01 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.08 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.7 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.7 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  30.56 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  31.19 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  40.58 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>