More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5147 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  87.59 
 
 		 158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  70.97 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  70.97 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  74.1 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  38.54 
 
 		 201 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.79 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  37.65 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  31.94 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.4 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  41.18 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>