More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0962 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.37 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  33.87 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  37.29 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  34.97 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  34.04 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  32.98 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  33.67 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.68 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.29 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  37.38 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.79 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  36.45 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>