More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1895 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  87.23 
 
 		 143 aa  255  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  41.82 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  41.82 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  42.86 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  26.15 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  38.36 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  27.69 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  29.17 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  30.17 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  26.98 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.57 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  25.69 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.24 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  30.36 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  25.89 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  25.55 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.72 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>