More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3305 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.09 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 165 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  32.03 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.8 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  31.09 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.88 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  29.06 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  29.75 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.09 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>